В сердце Японии снова разгорается хаос, и страшные тени прошлого возвращаются, чтобы испытать человечество на прочность. Год назад страна пережила разрушительную битву между гигантским монстром и его механическим двойником. Но спокойствие было недолгим, и новая угроза уже нависла над Токио. В воздухе витает предупреждение, требующее вернуть все, что осталось от первого нашествия, обратно в глубины океана. Кости, органические ткани, мельчайшие частицы — все это должно быть отправлено в бездну,
В мире, где гигантские монстры угрожают самому существованию человечества, японские ученые находятся на грани прорыва. Они создают два новейших вида оружия: суперсовременный воздушный корабль Грифон и мощное устройство «Приливная волна». Однако, в момент испытаний, неожиданно появляются Мегануроны — гигантские стрекозы, которые питаются энергией живых существ. Эти ужасающие создания становятся лишь предвестниками настоящей угрозы: Королевы Мегагирус, грозного монстра высотой в 60 метров,